История Свято-Троицкого Антониево-Сийского монастыря связана с царской династией Романовых. Здесь отбывал ссылку Федор Никитич Романов — отец будущего царя Михаила, впоследствии Патриарх всея Руси Филарет. В 1913 году, когда отмечалось 300-летие Дома Романовых, в честь небесного покровителя царя Михаила — преподобного Михаила Малеина — был освящен один из монастырских престолов. Накануне 400-летия Дома Романовых братия обители решила поставить храм в память царя-страстотерпца Николая.
15 сентября 2012 года в Антониево-Сийском монастыре прошли торжества, посвященные 20-летию возрождения обители. После Литургии был совершен Крестный ход, во время которого состоялось освящение закладного камня и водружение креста на месте будущей церкви во имя царя-страстотерпца Николая II. Автор проекта — Александр Геннадьевич Ляшенко, генподрядчик — ОАО «АрхангельскГражданРеконструкция» (председатель совета директоров Сергей Васильевич Киткин).
Строительство храма во имя царя-страстотерпца Николая началось 29 марта 2013 года. Весной был выполнен нулевой цикл — установлены винтовые сваи, сделан ростверк. Летом бригада каменщиков — Алексей Высоких, Виталий Нечаев, Петр Сидоренко — возвели стены храма. С ними работали рабочие из Узбекистана. В сентябре монтажники установили купол храма, возвели кровлю.
Летом 2014 года работы были продолжены, ко дню Святой Троицы бригада из Узбекистана выполнила работы по наружной обмазке храма. В сентябре электрики (бригадир Александр Поздеев) в Николаевском храме налажены электропроводка, система отопления, монтажники (бригадир Алексей Смирнов) установили оконные и дверные блоки. В октябре отделочники закончили чистовую побелку храма, керамической плиткой выложены полы. Бригадой Виталия Гапонова из фирмы «Гранат» (директор Александр Дроздов) гранитной плиткой облицовано крыльцо.
В ближайшее время ООО «Айрон» установит на крыльце металлические кованые ограждения. Мастерская Аркадия Холопова, что в Сергиевом Посаде, изготовит деревянный иконостас для храма. Иконы Божией Матери «Феодоровская» — покровительницы рода Романовых, Спасителя и царя-страстотерпца Николая напишут сийские иконописцы Сергей Егоров и Игорь Лапин. Церковь будет оборудована монашескими стасидиями — специальными стульями с высокой спинкой, откидными сидениями и высокими подлокотниками, где можно стоять, опираясь на подлокотники, полусидеть и сидеть. Стасидии в монастырях облегчают монахам долгие уставные службы. Чертежи для изготовления стасидий братия привезла из афонского монастыря. Их выполнят краснодеревщики генерального подрядчика строительства — ОАО «АрхангельскГражданРеконструкция».
Иеромонах Феофил.